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Cell Segmentation Free Analysis of Spatial Transcriptomics Data

Event Details
Date: 23.01.2024, 17:30 o'clock - 18:30 o'clock 
Location: Gro?er H?rsaal Universit?tsklinikum, Stenglinstra?e 2, 86156 Augsburg
Organizer(s): Lehrstuhl für Biomedizinische Informatik, Data Mining und Data Analytics
Topics: Informatik, Gesundheit und 威尼斯赌博游戏_威尼斯赌博app-【官网】izin
Series of events: 威尼斯赌博游戏_威尼斯赌博app-【官网】ical Information Sciences
Event Type: Vortragsreihe
Speaker(s): Naveed Ishaque, Ph.D.
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In diesem Wintersemester wird die im letzten Jahr erfolgreich gestartete Vortragsreihe 威尼斯赌博游戏_威尼斯赌博app-【官网】ical Information Sciences fortgesetzt. Renommierte Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler unterschiedlicher Fachdisziplinen und Forschungsstandorte geben jeden Dienstag ab 17:30 Uhr Einblicke in aktuelle Fragestellungen und Anwendungsgebiete des breiten Forschungsfeldes 威尼斯赌博游戏_威尼斯赌博app-【官网】ical Information Sciences.


Spatial transcriptomics technologies have revolutionised how we characterise cellular systems - they are able to profile gene expression in the native tissue context, thus preserving cellular organisation in tissue and niches. In this talk I will present some of the challenges associated with analysis spatial transcriptomics data, in particular cell segmentation, and how we are trying to develop tools to address these issues.

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